Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC148Q8NFR7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC148Q8NFR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms