Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
AVL9Q8NBF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms