Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEND4Q6ZU67 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms