Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SRCAPQ6ZRS2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms