Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A10Q6U841 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms