Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUX4L9Q6RFH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms