Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF7Q6Q0C0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms