Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASC4Q6P4E1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms