Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms