Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC19Q6DKK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms