Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD1Q5VV17 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms