Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38BQ5VTL8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms