Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRIP1Q5VSL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
STRIP1Q5VSL9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STRIP1Q5VSL9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms