Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BEND3Q5T5X7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BEND3Q5T5X7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms