Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf50Q5SZB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf50Q5SZB4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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