Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM240Q5SV17 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM240Q5SV17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms