Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN3Q5MJ09 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN3Q5MJ09 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms