Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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KRTAP13-3Q3SY46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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KRTAP13-3Q3SY46 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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