Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TXNRD1Q16881 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXNRD1Q16881 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TXNRD1Q16881 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TXNRD1Q16881 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TXNRD1Q16881 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TXNRD1Q16881 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TXNRD1Q16881 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
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