Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN1Q16512 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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