Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS2Q15018 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS2Q15018 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS2Q15018 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS2Q15018 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS2Q15018 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms