Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPNMBQ14956 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPNMBQ14956 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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