Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN2Q12907 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN2Q12907 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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