Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 MSE1YOL033W 1611 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YPL245WYPL245W 1365 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YLH47YPR125W 1365 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YGR266WYGR266W 2106 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 REV7YIL139C 738 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YLL059CYLL059C 507 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 MCM4YPR019W 2802 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 BOP2YLR267W 1713 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 KAP114YGL241W 3015 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 THI20YOL055C 1656 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ADE3YGR204W 2841 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ABF1YKL112W 2196 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 THP1YOL072W 1368 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YDL034WYDL034W 345 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SUR2YDR297W 1050 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 PCT1YGR202C 1275 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 PRE3YJL001W 648 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YPL113CYPL113C 1191 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ADE4YMR300C 1533 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ESF1YDR365C 1887 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 LYS21YDL131W 1323 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 AVT3YKL146W 2079 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 PRS2YER099C 957 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ZPS1YOL154W 750 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 snR19snR19 568 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 NPL6YMR091C 1308 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 IMD3YLR432W 1572 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 DFM1YDR411C 1026 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 LYS5YGL154C 819 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 CAB4YGR277C 918 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 FMP33YJL161W 543 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ECM19YLR390W 339 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YIM1YMR152W 1098 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 RPL3YOR063W 1164 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 HSP82YPL240C 2130 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 APE1YKL103C 1545 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 TOS4YLR183C 1470 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SKG3YLR187W 3081 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 NOB1YOR056C 1380 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 GAL10YBR019C 2100 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 KAR2YJL034W 2049 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SPO7YAL009W 780 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 YJL215CYJL215C 360 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 TRS33YOR115C 807 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 URA7YBL039C 1740 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 PUF3YLL013C 2640 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 VID22YLR373C 2706 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ALG2YGL065C 1512 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SEN34YAR008W 828 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SFT2YBL102W 648 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ARG1YOL058W 1263 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 SDA1YGR245C 2304 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ATG23YLR431C 1362 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG17Q06410 ASA1YPR085C 1332 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YDL144CYDL144C 1071 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YLR126CYLR126C 756 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 ATG17YLR423C 1254 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 REC114YMR133W 1287 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 HRK1YOR267C 2280 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 FAA4YMR246W 2085 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 PRP28YDR243C 1767 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 EUG1YDR518W 1554 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 SKI6YGR195W 741 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 GPP1YIL053W 753 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 SAC1YKL212W 1872 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 AVO2YMR068W 1281 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 TRM44YPL030W 1704 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 VBA2YBR293W 1425 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 TFG1YGR186W 2208 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 GIP1YBR045C 1920 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 MPH2YDL247W 1830 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 HIR2YOR038C 2628 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 RSM10YDR041W 612 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YGR122WYGR122W 1209 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 LEU1YGL009C 2340 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 COQ6YGR255C 1440 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 FRS1YLR060W 1788 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 CAD1YDR423C 1230 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 THI5YFL058W 1023 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 COS9YKL219W 1224 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 THI12YNL332W 1023 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 MAK3YPR051W 531 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 CNM67YNL225C 1746 nt4.74□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YPL260WYPL260W 1656 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YCR006CYCR006C 474 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 FUN19YAL034C 1242 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 CBT1YKL208W 816 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 TFS1YLR178C 660 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 STR2YJR130C 1920 nt4.73□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 RIM21YNL294C 1602 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 SUM1YDR310C 3189 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 TSL1YML100W 3297 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms