Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YNL174WYNL174W 573 nt5.66□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 AIF1YNR074C 1137 nt5.66□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 MRI1YPR118W 1236 nt5.66□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 RAD53YPL153C 2466 nt5.66□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 PRP31YGR091W 1485 nt5.65□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 YHR182WYHR182W 2358 nt5.65□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 BNA6YFR047C 888 nt5.65□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 PPG1YNR032W 1107 nt5.65□□□□□ -1.5
UBX2Q04228 MMT2YPL224C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 SDA1YGR245C 2304 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 PHM8YER037W 966 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YHR140WYHR140W 720 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YJL107CYJL107C 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 BUB3YOR026W 1026 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ETT1YOR051C 1239 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YJR124CYJR124C 1347 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 DAK1YML070W 1755 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 RTC1YOL138C 4026 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ERG4YGL012W 1422 nt5.64□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 XPT1YJR133W 630 nt5.63□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YBL010CYBL010C 843 nt5.63□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 HIR2YOR038C 2628 nt5.63□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 DAL81YIR023W 2913 nt5.63□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 PUS1YPL212C 1635 nt5.63□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ADE3YGR204W 2841 nt5.62□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 MDG1YNL173C 1101 nt5.62□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YEH2YLR020C 1617 nt5.62□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 BIT2YBR270C 1638 nt5.62□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 APC1YNL172W 5247 nt5.61□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 UBA2YDR390C 1911 nt5.61□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 SLT2YHR030C 1455 nt5.61□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.61□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 PDR10YOR328W 4695 nt5.61□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 DNF2YDR093W 4839 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 BPL1YDL141W 2073 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ALD3YMR169C 1521 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ALD2YMR170C 1521 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 FUM1YPL262W 1467 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 RML2YEL050C 1182 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 RHO3YIL118W 696 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 NRM1YNR009W 750 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 RDL2YOR286W 450 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 TFB4YPR056W 1017 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 MAG2YLR427W 2013 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 SYG1YIL047C 2709 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 CTS1YLR286C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 ATG14YBR128C 1035 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 UBP9YER098W 2265 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX2Q04228 SET5YHR207C 1581 nt5.59□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 NGL2YMR285C 1548 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 RIM15YFL033C 5313 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YDL023CYDL023C 321 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 AIR2YDL175C 1035 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YDR401WYDR401W 564 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ACP1YKL192C 378 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 NOC4YPR144C 1659 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ENP1YBR247C 1452 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 LYS2YBR115C 4179 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 TYW3YGL050W 822 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 MRF1YGL143C 1242 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YGP1YNL160W 1065 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 CKA2YOR061W 1020 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YPR071WYPR071W 636 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 TAH18YPR048W 1872 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 RRP3YHR065C 1506 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 DEF1YKL054C 2217 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 HES1YOR237W 1305 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ZPS1YOL154W 750 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 IMA1YGR287C 1770 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 BUD22YMR014W 1560 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 MKS1YNL076W 1755 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 GRX4YER174C 735 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YAR023CYAR023C 540 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 NMD4YLR363C 657 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 CTR3YLR411W 726 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ECM23YPL021W 564 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 GWT1YJL091C 1473 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ARB1YER036C 1833 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 HXT5YHR096C 1779 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YTA6YPL074W 2265 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 TRX2YGR209C 315 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 snR10snR10 245 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 SSH4YKL124W 1740 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ADE6YGR061C 4077 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YMR102CYMR102C 2505 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 DPH6YLR143W 2058 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YFR035CYFR035C 345 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YGL088WYGL088W 366 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 ORM1YGR038W 669 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YNL108CYNL108C 813 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 YNL181WYNL181W 1224 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 SOL1YNR034W 966 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 CDC4YFL009W 2340 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX2Q04228 HXT14YNL318C 1623 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 GTO1YGR154C 1071 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 NOP58YOR310C 1536 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms