Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN10P78369 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms