Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RACK1P63244 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RACK1P63244 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RACK1P63244 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RACK1P63244 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RACK1P63244 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RACK1P63244 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RACK1P63244 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RACK1P63244 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RACK1P63244 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RACK1P63244 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RACK1P63244 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RACK1P63244 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RACK1P63244 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RACK1P63244 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RACK1P63244 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RACK1P63244 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RACK1P63244 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RACK1P63244 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RACK1P63244 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RACK1P63244 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms