Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YARSP54577 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YARSP54577 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YARSP54577 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YARSP54577 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YARSP54577 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YARSP54577 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YARSP54577 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YARSP54577 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YARSP54577 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YARSP54577 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YARSP54577 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YARSP54577 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YARSP54577 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YARSP54577 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YARSP54577 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YARSP54577 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YARSP54577 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YARSP54577 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YARSP54577 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YARSP54577 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YARSP54577 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YARSP54577 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YARSP54577 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms