Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSHP51688 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSHP51688 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSHP51688 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSHP51688 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSHP51688 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSHP51688 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSHP51688 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSHP51688 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSHP51688 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSHP51688 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSHP51688 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSHP51688 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSHP51688 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSHP51688 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms