Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC1P48547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms