Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 TYW3YGL050W 822 nt6.33□□□□□ -1.4
PDR11P40550 YGL152CYGL152C 678 nt6.33□□□□□ -1.4
PDR11P40550 ICY2YPL250C 411 nt6.33□□□□□ -1.4
PDR11P40550 UBC8YEL012W 657 nt6.32□□□□□ -1.4
PDR11P40550 UGA1YGR019W 1416 nt6.32□□□□□ -1.4
PDR11P40550 GAD1YMR250W 1758 nt6.31□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SAP4YGL229C 2457 nt6.31□□□□□ -1.4
PDR11P40550 RTC1YOL138C 4026 nt6.31□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SKG3YLR187W 3081 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SUP56tL(CAA)A 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SUP53tL(CAA)C 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SUP54tL(CAA)G2 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 CTS2YDR371W 1536 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 IMA2YOL157C 1770 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR11P40550 NMD3YHR170W 1557 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 KGD1YIL125W 3045 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 RML2YEL050C 1182 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 MTM1YGR257C 1101 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 SSB2YNL209W 1842 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 YOL075CYOL075C 3885 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR11P40550 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR11P40550 GPA1YHR005C 1419 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR11P40550 LYP1YNL268W 1836 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR11P40550 MHF2YDL160C-A 243 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR11P40550 HSP150YJL159W 1242 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR11P40550 ISY1YJR050W 708 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RER1YCL001W 567 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR11P40550 MNN2YBR015C 1794 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR11P40550 SNA2YDR525W-A 240 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RPL14AYKL006W 417 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 YNG1YOR064C 660 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 YPR071WYPR071W 636 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 MET12YPL023C 1974 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 SYP1YCR030C 2613 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 NRD1YNL251C 1728 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR11P40550 BUD16YEL029C 939 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RRP40YOL142W 723 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 GSP2YOR185C 663 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 IMD3YLR432W 1572 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 DPB4YDR121W 591 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 COA3YJL062W-A 258 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 YOR379CYOR379C 339 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RCK2YLR248W 1833 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RVB1YDR190C 1392 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR11P40550 GDH2YDL215C 3279 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR11P40550 TMA17YDL110C 453 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RRN9YMR270C 1098 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR11P40550 FRS1YLR060W 1788 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR11P40550 AIM7YDR063W 450 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR11P40550 RPL43BYJR094W-A 279 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR11P40550 ABF1YKL112W 2196 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR11P40550 GDA1YEL042W 1557 nt6.21□□□□□ -1.41
PDR11P40550 CAF4YKR036C 1932 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 CPS1YJL172W 1731 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YER145C-AYER145C-A 438 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YGR127WYGR127W 939 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 GMH1YKR030W 822 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 NKP2YLR315W 462 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 DSC2YOL073C 969 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 ASF2YDL197C 1578 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 HAP1YLR256W 4509 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR11P40550 RCR2YDR003W 633 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR11P40550 RPL28YGL103W 450 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR11P40550 RPL19AYBR084C-A 570 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR11P40550 PDR10YOR328W 4695 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YER187WYER187W 426 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR11P40550 DBP9YLR276C 1785 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR11P40550 ASK10YGR097W 3441 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR11P40550 SMC5YOL034W 3282 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YEL067CYEL067C 588 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 PCT1YGR202C 1275 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YCL012CYCL012C 405 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 PHM7YOL084W 2976 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 MGS1YNL218W 1764 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR11P40550 AAD4YDL243C 990 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 API2YDR525W 330 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 GSY1YFR015C 2127 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 NCS6YGL211W 1080 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YJL193WYJL193W 1209 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 PUS5YLR165C 765 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 SOL1YNR034W 966 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YPR109WYPR109W 885 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 AKL1YBR059C 3327 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR11P40550 ARG82YDR173C 1068 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 PIC2YER053C 903 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 BSC5YNR069C 1470 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YDR306CYDR306C 1437 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 MAL13YGR288W 1422 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 YPL245WYPL245W 1365 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 CPR4YCR069W 957 nt6.16□□□□□ -1.42
PDR11P40550 FRA2YGL220W 363 nt6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms