Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBRP36941 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBRP36941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTBRP36941 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBRP36941 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBRP36941 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBRP36941 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBRP36941 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBRP36941 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBRP36941 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBRP36941 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBRP36941 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBRP36941 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBRP36941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBRP36941 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBRP36941 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBRP36941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms