Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms