Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SFTPDP35247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SFTPDP35247 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFTPDP35247 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFTPDP35247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SFTPDP35247 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms