Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col2a1P28481 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms