Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM3P25205 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM3P25205 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM3P25205 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM3P25205 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM3P25205 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM3P25205 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM3P25205 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM3P25205 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3P25205 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms