Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPAP23025 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPAP23025 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPAP23025 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPAP23025 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XPAP23025 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPAP23025 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPAP23025 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPAP23025 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPAP23025 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPAP23025 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPAP23025 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPAP23025 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPAP23025 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPAP23025 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPAP23025 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XPAP23025 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPAP23025 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPAP23025 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPAP23025 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPAP23025 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPAP23025 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPAP23025 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPAP23025 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPAP23025 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPAP23025 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPAP23025 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPAP23025 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPAP23025 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPAP23025 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPAP23025 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPAP23025 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPAP23025 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPAP23025 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
XPAP23025 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms