Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2EP19388 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2EP19388 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms