Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPCAMP16422 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms