Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKBP12277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKBP12277 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKBP12277 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKBP12277 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKBP12277 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKBP12277 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKBP12277 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKBP12277 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKBP12277 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKBP12277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKBP12277 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CKBP12277 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKBP12277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms