Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufb1P0DN34 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufb1P0DN34 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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