Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLR1AO95602 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR1AO95602 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLR1AO95602 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.79■■■■□ 3
POLR1AO95602 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLR1AO95602 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR1AO95602 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLR1AO95602 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLR1AO95602 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLR1AO95602 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms