Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPP2O95045 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPP2O95045 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP2O95045 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP2O95045 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP2O95045 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP2O95045 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP2O95045 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP2O95045 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPP2O95045 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPP2O95045 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP2O95045 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP2O95045 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP2O95045 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP2O95045 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP2O95045 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP2O95045 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP2O95045 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UPP2O95045 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPP2O95045 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UPP2O95045 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPP2O95045 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPP2O95045 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPP2O95045 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPP2O95045 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms