Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM1O75626 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM1O75626 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms