Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms