Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ2O15056 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ2O15056 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms