Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRTO14522 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRTO14522 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
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