Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F3O00716 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F3O00716 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F3O00716 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F3O00716 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F3O00716 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F3O00716 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F3O00716 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F3O00716 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms