Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C5orf51A6NDU8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C5orf51A6NDU8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C5orf51A6NDU8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C5orf51A6NDU8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms