Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMB4A4D0S4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms